1936-1939:
Guerra civil. Se hace cargo interinamente el socio bibliotecario
Bernardo G. de Candamo. La dirección efectiva la lleva
el vicepresidente Manuel Bastos Ansart.
Al acabar la Guerra Civil, en el Ateneo se instaló la Delegación Provincial de Educación Nacional de FET y de las JONS, hasta marzo de 1946. El delegado provincial de Eduación Nacional fue en este tiempo el máximo responsable del Ateneo, que perdió su nombre y fue bautizado como "Aula de Cultura"
Según una orden del Ministerio de Educación de 23 de marzo de 1946 el Ateneo de Madrid recobró su nombre tradicional y se eliminó la denominación de “Aula de Cultura”, impuesta tras el final de la Guerra Civil. El Ateneo pasó a depender directamente de la Dirección General de Propaganda, adscrita al Ministerio de Educación. Como órgano de gobierno se constituyó una Consejo Rector, bajo la presidencia del director general de Propaganda.
